Возможность удалять и редактировать файлы реализована в версии ВКонтакте для компьютера.
Откройте список всех файлов (vk.com/docs) и нажмите на крестик справа от названия файла, который вы хотите удалить. Чтобы отредактировать файл, нажмите на значок карандаша.
Если в меню слева нет раздела с файлами, то нужно заглянуть в Настройки (vk.com/settings) → Настроить отображение пунктов меню и во вкладке Основные поставить галочку рядом с пунктом Файлы.